Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MDH1P40925 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MDH1P40925 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDH1P40925 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDH1P40925 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDH1P40925 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDH1P40925 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDH1P40925 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDH1P40925 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MDH1P40925 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MDH1P40925 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDH1P40925 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDH1P40925 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms