Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGCXP38435 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GGCXP38435 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GGCXP38435 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GGCXP38435 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGCXP38435 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGCXP38435 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGCXP38435 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms