Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHRNA7P36544 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHRNA7P36544 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms