Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5C1P36542 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP5C1P36542 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATP5C1P36542 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms