Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM23P36406 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM23P36406 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms