Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GJC1P36383 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GJC1P36383 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GJC1P36383 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJC1P36383 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJC1P36383 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJC1P36383 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms