Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD12P35452 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXD12P35452 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms