Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFC1P35251 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC1P35251 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC1P35251 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC1P35251 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms