Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPC1P35052 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPC1P35052 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPC1P35052 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GPC1P35052 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GPC1P35052 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GPC1P35052 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GPC1P35052 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GPC1P35052 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms