Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR1P32246 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR1P32246 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR1P32246 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR1P32246 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCR1P32246 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR1P32246 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR1P32246 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR1P32246 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR1P32246 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR1P32246 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR1P32246 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR1P32246 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR1P32246 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms