Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFNP31947 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFNP31947 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFNP31947 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFNP31947 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFNP31947 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFNP31947 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFNP31947 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFNP31947 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFNP31947 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFNP31947 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFNP31947 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms