Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
CLIP1P30622 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CLIP1P30622 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLIP1P30622 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms