Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CMPK1P30085 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK1P30085 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK1P30085 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK1P30085 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK1P30085 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK1P30085 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CMPK1P30085 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CMPK1P30085 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms