Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMOD1P29536 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMOD1P29536 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMOD1P29536 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms