Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLD1P28340 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD1P28340 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD1P28340 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD1P28340 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLD1P28340 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD1P28340 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLD1P28340 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLD1P28340 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLD1P28340 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLD1P28340 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLD1P28340 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
POLD1P28340 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLD1P28340 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLD1P28340 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLD1P28340 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLD1P28340 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms