Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMB6P28072 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms