Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HLA-DMAP28067 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms