Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VARSP26640 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VARSP26640 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VARSP26640 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VARSP26640 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VARSP26640 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VARSP26640 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VARSP26640 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VARSP26640 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VARSP26640 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VARSP26640 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VARSP26640 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VARSP26640 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VARSP26640 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VARSP26640 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VARSP26640 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VARSP26640 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VARSP26640 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms