Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN3P26045 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN3P26045 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms