Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA4P25789 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA4P25789 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA4P25789 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms