Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA2P25787 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMA2P25787 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms