Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX3P23760 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX3P23760 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAX3P23760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAX3P23760 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX3P23760 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX3P23760 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAX3P23760 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX3P23760 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAX3P23760 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms