Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1D1P20393 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1D1P20393 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms