Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB4AP20338 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB4AP20338 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms