Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGB6P18564 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGB6P18564 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms