Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LBPP18428 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LBPP18428 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LBPP18428 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LBPP18428 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LBPP18428 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LBPP18428 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LBPP18428 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LBPP18428 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LBPP18428 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LBPP18428 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LBPP18428 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LBPP18428 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LBPP18428 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LBPP18428 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LBPP18428 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LBPP18428 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LBPP18428 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LBPP18428 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LBPP18428 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms