Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCLP18206 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCLP18206 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCLP18206 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCLP18206 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCLP18206 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCLP18206 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCLP18206 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCLP18206 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCLP18206 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCLP18206 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCLP18206 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCLP18206 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCLP18206 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCLP18206 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCLP18206 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms