Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAP43P17677 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAP43P17677 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAP43P17677 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAP43P17677 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAP43P17677 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAP43P17677 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAP43P17677 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAP43P17677 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAP43P17677 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAP43P17677 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAP43P17677 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAP43P17677 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GAP43P17677 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAP43P17677 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAP43P17677 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GAP43P17677 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAP43P17677 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms