Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYN1P17600 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYN1P17600 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYN1P17600 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYN1P17600 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYN1P17600 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYN1P17600 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYN1P17600 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYN1P17600 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYN1P17600 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYN1P17600 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYN1P17600 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYN1P17600 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms