Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE6AP16499 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms