Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF2RAP15509 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2RAP15509 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2RAP15509 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms