Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPA1P15085 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPA1P15085 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CPA1P15085 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPA1P15085 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CPA1P15085 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPA1P15085 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPA1P15085 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPA1P15085 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA1P15085 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CPA1P15085 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms