Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NID1P14543 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NID1P14543 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NID1P14543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NID1P14543 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NID1P14543 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NID1P14543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NID1P14543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NID1P14543 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NID1P14543 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NID1P14543 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NID1P14543 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NID1P14543 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NID1P14543 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NID1P14543 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NID1P14543 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NID1P14543 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NID1P14543 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms