Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RARGP13631 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RARGP13631 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RARGP13631 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RARGP13631 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RARGP13631 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RARGP13631 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RARGP13631 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RARGP13631 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RARGP13631 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RARGP13631 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms