Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GP1BBP13224 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GP1BBP13224 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms