Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
VPREB1P12018 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms