Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VDRP11473 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VDRP11473 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VDRP11473 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VDRP11473 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VDRP11473 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VDRP11473 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VDRP11473 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VDRP11473 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VDRP11473 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VDRP11473 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VDRP11473 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VDRP11473 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VDRP11473 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms