Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TOP1P11387 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TOP1P11387 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1P11387 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TOP1P11387 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TOP1P11387 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TOP1P11387 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TOP1P11387 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TOP1P11387 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TOP1P11387 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOP1P11387 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOP1P11387 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TOP1P11387 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TOP1P11387 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TOP1P11387 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TOP1P11387 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TOP1P11387 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms