Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2P10911 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2P10911 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCF2P10911 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCF2P10911 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2P10911 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2P10911 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2P10911 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCF2P10911 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCF2P10911 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCF2P10911 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCF2P10911 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms