Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GLI2P10070 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GLI2P10070 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
GLI2P10070 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GLI2P10070 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GLI2P10070 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GLI2P10070 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GLI2P10070 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GLI2P10070 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GLI2P10070 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GLI2P10070 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GLI2P10070 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI2P10070 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI2P10070 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI2P10070 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI2P10070 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI2P10070 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI2P10070 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GLI2P10070 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GLI2P10070 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GLI2P10070 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
GLI2P10070 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GLI2P10070 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI2P10070 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
GLI2P10070 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI2P10070 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms