Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P0DMU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P0DMU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P0DMU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P0DMU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P0DMU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P0DMU3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P0DMU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P0DMU3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0DMU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0DMU3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P0DMU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P0DMU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms