Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTSLP07711 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTSLP07711 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTSLP07711 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTSLP07711 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTSLP07711 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTSLP07711 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms