Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
POLR3DP05423 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLR3DP05423 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLR3DP05423 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms