Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CYBBP04839 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CYBBP04839 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CYBBP04839 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYBBP04839 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYBBP04839 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYBBP04839 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYBBP04839 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYBBP04839 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYBBP04839 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYBBP04839 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYBBP04839 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYBBP04839 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms