Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBB4AP04350 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4AP04350 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms