Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNAP02545 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNAP02545 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNAP02545 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNAP02545 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNAP02545 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNAP02545 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNAP02545 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMNAP02545 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNAP02545 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNAP02545 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms