Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IGHV3-7P01780 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGHV3-7P01780 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms