Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
STAMBPO95630 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
STAMBPO95630 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
STAMBPO95630 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
STAMBPO95630 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
STAMBPO95630 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STAMBPO95630 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STAMBPO95630 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STAMBPO95630 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STAMBPO95630 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms