Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
POLR1AO95602 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
POLR1AO95602 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
POLR1AO95602 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms