Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB5O95377 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB5O95377 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJB5O95377 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJB5O95377 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJB5O95377 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB5O95377 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB5O95377 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB5O95377 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GJB5O95377 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms